編碼器輸出方法包括增量法和絕對法，增量法以相對起始位置的相對角度輸出，絕對法以絕對角度輸出。磁性編碼器具有與絕對角度相對應的正弦波電壓波形，因此比光學編碼器更容易輸出絕對值。

典型的磁編碼器由磁傳感器和永磁體組成。

1. 磁傳感器

磁傳感器使用霍爾元件、MR元件等。霍爾元件是一種利用霍爾效應檢測磁性的傳感器，當電流通過半導體薄膜時，霍爾元件會根據磁通密度和方向產生電壓。

MR元件也稱為磁阻元件，是利用電阻值根據磁場強度而變化的磁阻效應來檢測磁性的傳感器。

2、永磁體

永磁體附著在旋轉或移動的物體上。當軸旋轉并且永磁體的位置發生變化時，磁場分布發生變化，施加到磁傳感器上的磁通密度發生變化。磁傳感器將磁通密度的變化轉換成電信號，可以輸出軸位置信息。